从美国队归来的海耶斯,开始了自己在肯塔基大学的大三赛季。尽管博甘斯大学毕业,离开了野猫队,但球队的其他几员主力——凯伦纳·阿祖拜克、杰拉德、芬奇和埃里克·丹尼尔斯都是海耶斯的老搭档了,而他在球队的战术体系中也越发重要。
赛季开始仅6场,他就3次拿到两双,更是在面对印第安那大学时刷新了自己的得分记录——22分。此后,在面对田纳西大学的比赛中,海耶斯又拿到18分16个篮板的大号两双;在赛季结束前的分区决赛上,他又拿下了23分的大学生涯最高分,带领球队战胜了大卫·李率领的佛罗里达大学,卫冕了分区赛冠军。
整个赛季下来,海耶斯场均出场31分钟,位居全队之首;得到10.7分和8.1个篮板,篮板球同样领先全队;更为难能可贵的是,他场均竟然还能贡献3次助攻,仅次于球队首席控卫霍金斯;1.4次盖帽和1.3次抢断也分列球队第1和第2。凭借出色表现,海耶斯最终入选了赛区第二阵容,以及分区赛第一阵容。
大学的最后一年,海耶斯再接再厉,作为首发打满34场比赛,带领野猫队取得28胜6负的佳绩,并且连续第3年杀入分区赛决赛,得分和篮板总数都创下了大学新高,成为了野猫队历史上继丹·伊赛尔之后第一个连续三年篮板数居全队之首的球员。赛季结束后,海耶斯毫无悬念地入选了赛区最佳阵容,并且成为了赛区年度最佳防守球员,同时他还获得了由美lian社选出的全美杰出表现奖。