在巴塞罗那载誉归来的巴克利立刻飞到了菲尼克斯,与太阳队会合。当时的太阳队球星如云,有神射手马耶尔、安吉和明星后卫凯文约翰逊,是一支外线非常强大的快速进攻的机动部队,而拥有强大低位进攻能力的巴克利到来立刻弥补了太阳队唯一的缺陷,让太阳队成为了内外结合得最完美的一支球队,成为了夺取总冠军的大热门。在该赛季,巴克利场均取得25.6 分,12.2篮板,5.1助攻以及名列全联盟首位的6次三双,带领太阳队取得联盟最好战绩62胜20负,表现如日中天。凭着如此出色的表现,巴克利当选了最有价值球员,成为了NBA历史上第3位转队后首年便获得此荣誉的球员。进入季后赛,巴克利继续稳定而出色的演出,带领太阳队一路过关斩将,顺利杀进总决赛。在总决赛,太阳队面对的是“飞人”乔丹率领的公牛队。太阳队虽然实力不在公牛之下,但由于队中大部分球员都没有总决赛经验,结果在苦战六场后,太阳队败走麦城,巴克利含恨而归。太阳队在关键的第六场大好形势下由于队员的经验不足被公牛队一举翻盘,多少年后巴克利想起那场比赛还是激动不已。“直到今天,那场比赛还令我难受。如果我们注定要输球,也得输在我的手里。” 巴克利狠狠地说,“(最后时刻)我们的人连投两个都是‘三不沾’,还有一次失误,这种球要投也得让我来投,我的球即使是‘三不沾’,也比他们的‘三不沾’强。”这次总决赛的失利给了巴克利一个深刻的教训,“我不再相信任何人,除了自己;紧要关头,球一定要给我,我的自信超过任何人。”
这次总决赛被认为是NBA历史上最精彩最激烈的总决赛之一,不仅仅是因为乔丹和他的公牛队,还因为巴克利和他的太阳队。虽然含恨总决赛,但巴克利在季后赛还是打出了MVP应有的表现——场均26.6分, 13.6篮板及42.8分钟的上场时间。值得一提的是,在西部决赛对超音速队第7场生死战前,巴克利对教练说:“不要把我换下场调节体力,等我死后,多的是时间休息。”简直是酷毙了。结果巴克利在该场比赛中独得44分24篮板,率队大胜对手。
在接下来的1993——1994赛季,虽然巴克利深受伤病困扰,但夺取总冠军的梦想一直支持着他继续拼斗。该季巴克利只出场了65场比赛,但太阳队仍取得了56胜26负的战绩,以西部第三的身份进入季后赛。在季后赛第二轮中,太阳队遭遇后来夺得该季总冠军的休斯顿火箭队,双方激战7场,太阳以3比4败北。值得一提的是,在首轮对勇士队的第3场中,,巴克利31投23中,狂掠56分,成为该年季后赛单场最高分,并名列季后赛历史单场得分榜第3位。
1994——1995赛季,太阳队网罗了一心希望戴上总冠军戒指而不惜自降身价的优秀大前锋丹尼.曼宁,从国王队得到了实而不华的大前锋蒂斯代尔,又从选秀大会选中了射术精奇的新秀佩尔森。三员生力军的加入让太阳更加炽热,巴克利豪情万丈,再次吹响了向总冠军冲锋的号角。虽然巴克利在季初就因伤缺阵了11场,但一复出就有优秀的表现,带领太阳队以59胜23负的优异战绩顺利打进季后赛,并在首轮轻松击退开拓者,巴克利场均得33.7分和13.7篮板。在第二轮再次面对卫冕冠军火箭队,太阳队在3比1领先的情况下竟被对手连扳3场,反以3比4被淘汰,成就了火箭队的经典。火箭队成为了NBA成立以来第5支在季后赛由1比 3落后的情况下逆转获胜的球队。而打败太阳队后,火箭队气势如虹,一举夺得总冠军,卫冕成功。
连续两年在大好形势下被火箭队打败,太阳队锐气顿失,特别队中球员的伤病不断,阵容不整,实力受到了极大的削弱。在1995——1996赛季,太阳队只取得了41胜41负的战绩,勉强挤进季后赛,结果在首轮就被大卫.罗宾逊率领的圣安东尼奥马刺队轻取,提前结束了季后赛之旅。眼看冠军梦渐行渐远,已经不再年轻的巴克利又动了转会的念头,这次他的目标就是刚夺得两连冠的火箭队。火箭队一听巴克利对己有意,喜出望外,马上与太阳队磋商,用萨姆.卡塞尔、罗伯特.霍里等四员大将把巴克利收归帐下。巧合的是,与上次转会时一样,在去新东家报到之前,巴克利还是要飞去另一个城市逗留一个月。因为巴克利再次入选了被称为“梦3队”的美国国家队,要为国在亚特兰大征战奥运会。